| Escola Municipal de Educação Básica Professora Maria Queiroz Ferro | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. · EJA | — | 4,9 |
| Escola Municipal de Educação Básica Padre Anchieta | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. · EJA | — | 4,8 |
| Escola Municipal de Educação Básica Vereador Manoel Juviniano dos Santos | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. I · EJA | — | 6,0 |
| Creche Municipal Dona São José | Municipal | São Sebastião | Infantil | — | — |
| Escola Municipal de Educação Básica Professora Maria de Fátima Regueira Pacheco | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. I · EJA | — | 6,8 |
| Escola São Matheus | Particular | São Sebastião | Infantil · Fund. | — | — |
| Escola Municipal de Educação Básica José Cazuza dos Santos | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. I · EJA | — | 5,3 |
| Escola Municipal de Educação Básica Leobino José do Nascimento | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. I · EJA | — | 7,3 |
| Escola Municipal de Educação Básica José Arnaldo Porfirio | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. I · EJA | — | 8,2 |
| Escola Municipal de Educação Básica Campos Sales | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. I · EJA | — | 6,4 |
| Escola Municipal de Educação Básica Rui Barbosa | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. I · EJA | — | 7,6 |
| Escola Municipal de Educação Básica Marechal Castelo Branco | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. I · EJA | — | 6,2 |
| Escola Municipal de Educação Básica Natanael da Silva | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. I | — | 6,3 |
| Escola Municipal de Educação Básica Dr. Deraldo Campos | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. I · EJA | — | — |
| Escola Municipal de Educação Básica Prudente de Morais | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. I · EJA | — | — |
| Escola Estadual Indígena Cacique Antônio Izidorio | Estadual | São Sebastião | Infantil · Fund. | — | 5,0 |
| Escola Municipal de Educação Básica Josefa de Souza Lima | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. I · EJA | — | 7,2 |
| Escola Municipal de Educação Básica Antônio Abilio de Lima | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. I · EJA | — | 6,6 |
| Escola Municipal de Educação Básica Professora Maria dos Martires Santos | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. I | — | — |
| Escola Municipal de Educação Básica Presidente Dutra | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. I · EJA | — | 6,3 |
| Escola Municipal de Educação Básica 31 de Maio | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. I · EJA | — | — |
| Escola Municipal de Educação Básica Juscelino Kubisthek | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. I · EJA | — | 6,2 |
| Escola Municipal de Educação Básica Professora Josilene Martiliano da Silva | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. I | — | — |
| Escola Municipal de Educação Básica Carolina Vicente Costa | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. I · EJA | — | — |
| Escola Municipal de Educação Básica Rodrigues Alves | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. I · EJA | — | 9,0 |
| Escola Municipal de Educação Básica Professora Maria Edelvita da Silva | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. I · EJA | — | — |
| Escola Municipal de Educação Básica 22 de Julho | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. I · EJA | — | — |
| Escola de Ensino Fundamental Professora Maria Jeilza de Jesus | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. I | — | — |
| Escola de Educação Básica Pingo de Mel | Particular | São Sebastião | Infantil · Fund. I | — | — |
| Escola Indígena Itapo | Estadual | São Sebastião | Infantil · Fund. | — | 5,3 |
| Escola Municipal de Educação Básica 16 de Setembro | Municipal | São Sebastião | Infantil · Fund. I | — | — |
| Centro Municipal de Educação Infantil Maria de Fátima Pacheco | Municipal | São Sebastião | Infantil | — | — |