| Colégio Militar Tiradentes I - São Luís | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | 617,4 | 6,1 |
| Colégio Militar 2 de Julho | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | 590,4 | 5,6 |
| Colégio Militar 2 de Julho - Anexo Pio XII | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | 546,3 | 5,3 |
| Centro de Ensino Santa Teresa | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | 516,2 | 4,7 |
| Centro Educa Mais Professora Margarida Pires Leal | Estadual | São Luís | Médio | 512,8 | 4,8 |
| Centro Educa Mais João Francisco Lisboa | Estadual | São Luís | Médio | 510,2 | 5,3 |
| Centro Educa Mais Professora Maria Pinho | Estadual | São Luís | Médio | 509,2 | 4,7 |
| Centro de Ensino São José Operario | Estadual | São Luís | Médio | 508,0 | 4,5 |
| Centro de Ensino Renascenca | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | 505,9 | — |
| Centro de Ensino Estado do Mato Grosso | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio · EJA | 504,0 | 4,4 |
| Instituto Estadual de Educação Ciencia e Tecnologia do Ma - Iema Pleno São Luís Centro | Estadual | São Luís | Médio | 502,6 | 5,0 |
| Centro de Ensino Jackson Lago | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio · EJA | 501,5 | 4,2 |
| Instituto Estadual de Educação Ciencia e Tecnologia do Ma -iema Unidadae Plena -São Luís Sousandrade | Estadual | São Luís | Médio | 498,9 | 4,4 |
| Centro Educa Mais Dayse Galvao de Sousa | Estadual | São Luís | Médio | 497,4 | 4,7 |
| Instituto Estadual de Educação Ciencia e Tecnologia do Ma - Iema Pleno São Luís Bacelar Portela | Estadual | São Luís | Médio | 496,3 | 4,2 |
| Instituto Estadual de Educação Ciencia e Tecnologia do Ma - Iema Pleno São Luís - Manoel Beckman | Estadual | São Luís | Médio · EJA | 495,9 | — |
| Instituto Estadual de Educação Ciencia e Tecnologia do Ma - Iema Pleno São Luís Rio Anil | Estadual | São Luís | Médio · EJA | 495,3 | 4,2 |
| Centro Educa Mais Almirante Tamandare | Estadual | São Luís | Médio | 494,6 | 4,7 |
| Centro de Ensino Dr. Clarindo Santiago | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | 494,3 | 4,3 |
| Instituto Estadual de Educação Ciencia e Tecnologia do Ma - Iema Pleno São Luís Tamancao | Estadual | São Luís | Médio | 493,1 | 4,3 |
| Centro Educa Mais Menino Jesus de Praga | Estadual | São Luís | Médio | 492,9 | 4,4 |
| Instituto Estadual de Educação Ciencia e Tecnologia do Ma Iema Pleno São Luís - Maria Monica Vale | Estadual | São Luís | Médio | 492,4 | 4,5 |
| Centro de Ensino Conego Ribamar Carvalho | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | 490,6 | 4,4 |
| Centro Educa Mais Paulo VI | Estadual | São Luís | Médio · EJA | 490,6 | 4,7 |
| Instituto Estadual de Educ Ciencia e Tecnologia do Ma - Iema Unidade Vocacional Estado do Ceara | Estadual | São Luís | Médio | 490,0 | 4,3 |
| Centro Educa Mais Y Bacanga | Estadual | São Luís | Médio | 489,7 | 4,0 |
| Centro Educa Mais Joaquim Gomes de Sousa | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | 488,6 | 4,2 |
| Instituto Estadual de Educação Ciencia e Tecnologia do Ma- Iema Pleno São Luis-newton Barjonas Lobao | Estadual | São Luís | Médio | 487,1 | 3,5 |
| Centro de Ensino Maria Firmina dos Reis | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio · EJA | 486,9 | 3,5 |
| Centro de Ensino Japiacu | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | 486,4 | 4,1 |
| Centro de Ensino São Cristovao - Anexo III - São Bernardo | Estadual | São Luís | Médio · EJA | 486,2 | 4,2 |
| Centro Educa Mais Maria José Aragao | Estadual | São Luís | Médio | 485,0 | 4,2 |
| Centro de Ensino Professor José do Nascimento Moraes | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | 485,0 | 3,7 |
| Instituto Estadual de Educação Ciencia e Tecnologia do Ma - Iema Unidade Plena Desembargador Sarney | Estadual | São Luís | Médio | 484,5 | 4,3 |
| Centro Educa Mais Estefania Rosa da Silva | Estadual | São Luís | Médio | 483,6 | 4,7 |
| Centro de Ensino Liceu Maranhense | Estadual | São Luís | Médio · EJA | 483,3 | 4,3 |
| Centro de Ensino Cidade Operaria I | Estadual | São Luís | Médio · EJA | 483,0 | 4,1 |
| Centro Educa Mais Cidade Operaria II | Estadual | São Luís | Médio | 482,8 | 4,0 |
| Centro de Ensino Professora Maria do Socorro Almeida | Estadual | São Luís | Médio | 482,2 | 4,1 |
| Instituto Estadual de Educação Ciencia e Tecnologia do Ma - Iema Pleno São Luís Goncalves Dias | Estadual | São Luís | Médio | 481,7 | 3,9 |
| Centro de Ensino Humberto de Campos | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | 481,7 | 4,1 |
| Centro de Ensino Cruzeiro de Santa Barbara | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio · EJA | 481,5 | 4,3 |
| Centro de Ensino Professora Janilde Silva de Aquino | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | 481,3 | 4,4 |
| Centro de Ensino São Cristovao | Estadual | São Luís | Médio · EJA | 479,5 | 4,3 |
| Centro de Ensino Pedro Alvares Cabral | Estadual | São Luís | Médio · EJA | 478,6 | — |
| Centro de Ensino Haydee Chaves | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | 477,7 | 3,6 |
| Centro Educa Mais Professor Ignacio Rangel | Estadual | São Luís | Médio | 477,3 | 5,3 |
| Centro de Ensino Paulo Freire | Estadual | São Luís | Médio | 477,2 | — |
| Centro de Ensino Estado do Rio Grande do Norte | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | 475,8 | 4,4 |
| Centro de Ensino José Justino Pereira | Estadual | São Luís | Médio | 475,5 | 3,8 |
| Centro de Ensino João Paulo II | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio · EJA | 474,8 | 3,7 |
| Centro de Ensino Coelho Neto - Turu | Estadual | São Luís | Médio | 474,7 | 3,7 |
| Instituto Estadual de Educação Ciencia e Tecnologia do Ma - Iema Pleno São Lus - Jardim America | Estadual | São Luís | Médio | 473,5 | 4,2 |
| Centro de Ensino Viriato Correa | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | 473,4 | 3,9 |
| Instituto Estadual de Educação Ciencia e Tecnologia do Maranhao-iema Pleno São Luís Cohab | Estadual | São Luís | Médio · EJA | 472,0 | 4,0 |
| Centro de Ensino Josue Montello | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | 470,6 | 4,1 |
| Centro de Ensino Lucia Chaves | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | 470,1 | 4,3 |
| Centro Educa Mais Padre José Braulio Sousa Ayres | Estadual | São Luís | Médio · EJA | 469,3 | 3,5 |
| Centro de Ensino Fernando Perdigao | Estadual | São Luís | Médio · EJA | 467,9 | — |
| Centro Educa Mais Cruzeiro do Sul | Estadual | São Luís | Médio | 467,4 | 3,7 |
| Centro de Ensino Barbosa de Godois | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | 467,2 | 4,1 |
| Centro de Ensino Dr. Geraldo Melo | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | 467,2 | 3,6 |
| Centro de Ensino Vinicius de Moraes | Estadual | São Luís | Médio | 466,9 | 3,5 |
| Centro de Ensino Bernardo Coelho de Almeida | Estadual | São Luís | Médio | 466,9 | 3,7 |
| Centro de Ensino de Educação de Jovens e Adultos | Estadual | São Luís | EJA | 465,4 | — |
| Centro de Ensino Governador Archer | Estadual | São Luís | Médio | 464,8 | 3,8 |
| Centro Educa Mais Julio de Mesquita Filho | Estadual | São Luís | Médio | 462,7 | 4,2 |
| Centro de Ensino Professor Ezelberto Martins | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio · EJA | 461,3 | 4,6 |
| Centro Educa Mais Dorilene Silva Castro | Estadual | São Luís | Médio · EJA | 460,8 | 4,2 |
| Centro de Ensino Professor João Pereira Martins Neto | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | 460,5 | 4,4 |
| Centro de Ensino Dr. Antônio Jorge Dino | Estadual | São Luís | Médio | 459,7 | 3,7 |
| Centro de Ensino Vicente Maia | Estadual | São Luís | Médio · EJA | 457,4 | 3,6 |
| Centro de Ensino João Evangelista Serra dos Santos | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | 455,5 | 3,5 |
| Instituto Estadual de Educ Ciencia e Tec do Ma - Iema Unidade Vocacional Integrada do Campo Vila Ma | Estadual | São Luís | Médio · EJA | 454,4 | — |
| Centro de Ensino General Artur Carvalho | Estadual | São Luís | Médio · EJA | 453,8 | 3,2 |
| Centro Educa Mais Professor Luiz Alves Ferreira | Estadual | São Luís | Médio · EJA | 453,8 | 3,8 |
| Centro de Ensino Odylo Costa Filho | Estadual | São Luís | Médio · EJA | 453,0 | 3,9 |
| Instituto Estadual de Educação Ciencia e Tecnologia do Ma - Iema Pleno São Luís Itaqui Bacanga | Estadual | São Luís | Médio | 452,5 | 3,7 |
| Centro Educa Mais Benedito Leite | Estadual | São Luís | Médio | 449,7 | 3,9 |
| Centro de Ensino Professora Maria Helena Rocha | Estadual | São Luís | Médio | 449,5 | — |
| Centro Educa Mais Desembargador Emesio Dario de Araujo | Estadual | São Luís | Médio · EJA | 448,8 | 3,7 |
| Centro de Ensino Salim Braid | Estadual | São Luís | Médio · EJA | 448,1 | 3,0 |
| Centro de Ensino Dr. Francisco de Assis Ximenes Aragao Filho | Estadual | São Luís | Médio · EJA | 444,7 | 3,5 |
| Centro de Ensino Juvencio Matos | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio · EJA | 444,1 | 3,2 |
| Centro Educa Mais Coelho Neto | Estadual | São Luís | Médio · EJA | 441,2 | 3,3 |
| Instituto Estadual de Educao Cincia e Tecnologia do Ma - Iema Pleno São Luís Mario Martins Meireles | Estadual | São Luís | Médio · EJA | 440,5 | 3,7 |
| Centro de Ensino Sotero dos Reis | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | 437,2 | 3,1 |
| Centro de Ensino Renato Archer | Estadual | São Luís | Médio · EJA | 434,5 | — |
| Centro de Ensino Lara Ribas | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | 433,2 | 4,2 |
| Centro de Ensino Anjo da Guarda | Estadual | São Luís | Médio | 429,7 | 3,5 |
| Centro de Ensino Antônio Ribeiro da Silva | Estadual | São Luís | Fund. · Médio · EJA | 424,7 | 3,3 |
| Centro de Ensino Professor Rubem Almeida | Estadual | São Luís | Fund. I · Médio | 420,9 | 3,0 |
| Centro de Ensino José Giorcelli Costa | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | 414,9 | 3,3 |
| Centro de Ensino João Sobreira de Lima | Estadual | São Luís | EJA | — | — |
| Unidade Integrada Governador José Murad | Estadual | São Luís | Fund. | — | 3,9 |
| Instituto Estadual de Educação Ciencia e Tecnologia do Maranhao - Iema Bilíngue e Integral | Estadual | São Luís | Fund. | — | 6,6 |
| Unidade Integrada Francisco de Assis Sousa | Estadual | São Luís | Fund. II | — | 3,5 |
| Unidade Integrada Estado de São Paulo | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio | — | 3,7 |
| Centro de Ensino Santa Barbara | Estadual | São Luís | Fund. II · Médio · EJA | — | 3,6 |
| Escola de Musica do Estado do Maranhao Lilah Lisboa de Araujo | Estadual | São Luís | — | — | — |
| Centro Integral de Educação Infantil - Creche da Liberdade | Estadual | São Luís | Infantil | — | — |
| Centro de Ensino Professora Maria do Socorro Almeida - Anexo I - Quebra-pote | Estadual | São Luís | Médio | — | — |
| Centro Integral de Educação Infantil - Creche do Centro | Estadual | São Luís | Infantil | — | — |
| Centro de Ensino Profissionalizante de Artes Cenicas do Maranhao | Estadual | São Luís | — | — | — |
| Centro Educa Mais Estado do Amazonas | Estadual | São Luís | Médio | — | 4,1 |
| Centro de Ensino Nerval Lebre Santiago | Estadual | São Luís | Médio | — | 3,2 |
| Centro de Ensino Professora Rosa Castro | Estadual | São Luís | Médio · EJA | — | — |
| Iema Instituto Estadual de Educação Ciencia e Tecnologia do Ma Unidade Vocacional Gastronomia | Estadual | São Luís | EJA | — | — |
| Iema Instituto Estadual de Educação Ciencia e Tecnologia do Maranhao Unidade Vocacional Idiomas | Estadual | São Luís | — | — | — |
| Iema Instituto Estadual de Educação Ciencia e Tecnologia do Maranhao Und Vocacional Escola de Cinema | Estadual | São Luís | — | — | — |
| Centro de Educação Especial Padre João Mohana | Estadual | São Luís | Fund. | — | — |
| Unidade Integrada Helena Antipoff | Estadual | São Luís | Fund. | — | — |
| Iema - Instituto Estadual de Educação Ciencia e Tecnologia do Ma - Unidade Vocacional Estaleiro Esco | Estadual | São Luís | EJA | — | — |
| Iema Instituto Estadual de Educação Ciencia e Tecnologia do Maranhao Unidade Vocacional Rio Anil | Estadual | São Luís | — | — | — |
| Centro de Educação Especial Nucleo de Atividades de Altas Habilidades e Superdotacao Joaosinho Trint | Estadual | São Luís | — | — | — |
| Centro de Educação Especial Professora Ana Maria Patello Saldanha | Estadual | São Luís | — | — | — |
| Centro de Educação Especial Professora Maria da Glória Costa Arcangeli | Estadual | São Luís | — | — | — |
| Iema - Instituto Estadual de Educação Ciencia e Tecnologia do Ma - Unidade Vocacional São Luís Praia | Estadual | São Luís | — | — | — |
| Iema Instituto Estadual de Educação Ciencia e Tecnologia do Ma Unidade Vocacional Dica Ferreira | Estadual | São Luís | — | — | — |